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秦兴虎

基本信息

秦兴虎,男,汉族,北京林业大学生态与自然保护学院副教授。英国BES 评审学院成员、项目评审专家,北京市高级人民法院司法鉴定专家、国际地球观测组织遗传组成工作组成员。曾任美国南加利福尼亚大学生物学院 Research Associate、访问学者。


通信地址:北京市海淀区清华东路35号主楼1119,邮编100083

E-mail:qinxh@bjfu.edu.cn


研究方向

运用前沿的机器学习等方法更好的解析生物大数据(从分子到生态系统,从微观到宏观),以揭示适应性进化以及复杂性状的分子遗传学基础,最终理解生物多样性(从基因多样性到物种多样性)的起源、发展和维持。

(1)机器学习、深度学习在多组学领域的开发与应用

(2)动植物群体遗传进化

(3)用多组学鉴定物种表型、适应性相关标志物,揭示物种适应性遗传进化机制

(4)基于新一代人工智能生物信息技术的个体地理溯源、种群迁徙、扩散及分化历史


研究概述

运用前沿的人工智能与新一代测序技术手段解析自然界生物大数据,从基因到生态系统,致力于全健康的研究,推进生物多样性保护与人类健康的共同发展。与美国、英国、澳大利亚、新西兰、巴西、印度、孟加拉国等国家的顶尖实验室建立了长期密切的合作关系。研究领域涉及人工智能、群体遗传、生物多样性、生态、进化、野生动植物保护与利用、生物防治、康养等,研究对象涉及动、植物,包括无脊椎动物、人类、家畜、濒危野生动物、油料作物、野生药用动植物等。相关成果已在Briefings in Bioinformatics、Methods in Ecology and Evolution、Molecular Ecology Resources,Science of the Total Environment等期刊发表论文21篇,其中第一作者及通讯作者11篇,近五年IF>10有3篇,受邀发表专著章节2章,授权国家发明专利6项,获软件著作权5项;主持国家自然科学基金等项目;获肯穆雷爵士捐赠基金学术奖(2020)、英国费舍尔纪念信托奖(2019)及国际生物防治组织(IOBC)青年科学家奖(2018)。


教育经历

2016年8月-2021年6月 圣安德鲁斯大学 博士

2020年3月-2021年3月 南加利福尼亚大学 访问学者

2013年9月-2016年7月 中国农业科学院研究生院 硕士

2009年9月-2013年7月 山东农业大学 本科(双学位)


所获奖励

2016年国家建设高水平大学公派博士奖学金(CSC- University of St Andrews joint Scholarship)

2016-2020. St Leonards 7th Century Scholarship

2016-2020. School of Biology PG Scholarship

2018.5. IOBC Early Career Scientist Award, International Organisation for Biological Control

2019 Fisher Memorial Trust award

2020 Sir Ken Murray Endowment Fund


发表文章 (第一作者/通讯作者#)

1. Qin, X.# (通讯作者), Chiang, C., Gaggiotti, EO. 2022. Deciphering signatures of natural selection via deep learning. Briefings in Bioinformatics. 23(5): 1-10. IF= 13.994, JCR Q1

2. Qin, X.# (通讯作者), Chiang, C. W., & Gaggiotti, O. E. 2022. KLFDAPC: a supervised machine learning approach for spatial genetic structure analysis. Briefings in Bioinformatics, 23(5):1-16. IF= 13.994, JCR Q1

3. Qin, X.# (通讯作者), Gaggiotti, EO. 2022. Information-based summary statistics for spatial genetic structure inference. Molecular Ecology Resources. 22(6):2183-2195. IF= 8.678, JCR Q1

4. Qin, X.# (通讯作者), et al. DA: Population Genetic Structure Inference Using Supervised Discriminant Analysis. 2021. Methods Ecology and Evolution,13 (2):485-499. IF=8.33, JCR Q1

5. Ali, M.P., Biswas, M, Clemente-Orta, G, …, Qin., X.#(通讯作者), Landis, D., Howlader, MTH. 2022. Landscape diversity influences the arthropod species diversity in rice field. Frontiers in Environmental Science. 10(5):1-15. IF=5.41, JCR Q2

6. Ali, M. P., Rahman, M. S., Nowrin, F., Haque, S. S., Qin, X. #(通讯作者), Haque, M. A., ... & Howlader, M. T. H. (2021). Salinity Influences Plant–Pest–Predator Tritrophic Interactions. Journal of Economic Entomology, 114(4), 1470-1479. IF=2.44, JCR Q2

7. Ali, M. P., Kabir, M. M. M., Haque, S. S., Afrin, S., Ahmed, N., Pittendrigh, B., & Qin, X.#(通讯作者). (2020). Surrounding landscape influences the abundance of insect predators in rice field. BMC Zoology, 5: 1-12. IF=1.769, JCR Q2

8. Qin. X.#(通讯作者),. et al. 2020. Precopulatory Oral Sex Contact Plays an Important Role in Copulatory Success in a Cryptic Desert Beetle. Ecology and Evolution. ECE36595. IF=3.167, JCR Q2

9. Qin, X., Hao, K., Ma, J., Huang, X., Tu, X., Ali, M. P., Pittendrigh, B. R., Cao, G., Wang, G., Nong, X., Whitman, D. W. & Zhang, 2017. Molecular ecological basis of grasshopper (Oedaleus asiaticus) phenotypic plasticity under environmental selection. Frontiers in Physiology. 8:770. IF=4.755, JCR Q1

10. Qin, X., Wu, H., Huang, X., Lock, T. R., Kallenbach, R. L., Ma, J., ... & Nong, X. (2019). Plant composition changes in a small-scale community have a large effect on the performance of an economically important grassland pest. BMC ecology, 19: 32. IF=3.368, JCR Q2

11. Qin, X., Ma, J., Huang, X., Kallenbach, R. L., Lock, T. R., Ali, M. & Zhang, Z. (2017). Population dynamics and transcriptomic responses of Chorthippus albonemus (Orthoptera: Acrididae) to herbivore grazing intensity. Frontiers in Ecology and Evolution. 5:136. IF=4.493, JCR Q2

12. Qin, X., & Zhang, Z. 2016. Combined control of Locusta migratoria manilensis by dissemination of Metarhizium anisopliae using Carabus smaragdinus as the vector. Abstract from “Biological and Integrated Control of Plant Pathogens” Proceedings of the Meeting "Biocontrol and Microbial Ecology" , Berlin, Germany.

13. 秦兴虎,吴惠惠等. 以绿步甲为载体携播绿僵菌对东亚飞蝗的控制作用[J].中国生物防治学报,2015, 31(2), 284-290. 中文核心

14. 秦兴虎,吴惠惠,黄训兵等. 内蒙古典型草原蝗虫群落结构和生态位研究[J].植物保护,2015,41(5), 17-25. 中文核心。

15. Ali, M. P., Kabir, M. M. M., Haque, S. S., Qin, X., Nasrin, S., Landis, D., ... & Ahmed, N. (2020). Farmer's behavior in pesticide use: Insights study from smallholder and intensive agricultural farms in Bangladesh. Sci. Total Environ., 747, 141160. IF= 10.753, JCR Q1


专著、论著章节

Qin, X., Wu, H., Zhang, W., Huang, X., & Zhang, Z. 2022. Molecular and Ecological Mechanisms of Grasshopper Food Selection and Habitat Adaptation. In Climate Change and Ecosystems (pp. 217-228). CRC Press.


学术任职

担任Briefings in Bioinformatics, Journal of Molecular Evolution,Current Bioinformatics, Biologia,Entropy,International journal of environmental research and public health,Systems等杂志审稿人;GEO-WG工作组成员


授权国家发明专利

1.一种捕食性天敌昆虫绿步甲与绿僵菌组合防治害虫的方法(专利号:ZL 201310739100);

2. 一种用AMPKγ基因评价昆虫发育速率的方法(专利号:ZL201510236419)

3. 一种用乙醛脱氢酶基因评价昆虫的发育速率的方法(专利号:ZL201510236534)

4.一种预测不同植物群落中昆虫食物选择性指数的方法及其应用(专利号:ZL201510279821)

5.一种预测不同植物群落中昆虫食物生态位的方法(专利号:ZL201510279822)

6.一种草地植被亚型的建立及数字化表示方法(专利号:ZL201410397373)


软件著作权

(1) 秦兴虎; 多功能判别分析机器学习软件和平台(DA)[简称:DA] V.0.2.0, 7847040, 原始取得, 全部权利, 2020-11-05 (软件著作权)

(2) 秦兴虎; 高效高通量基因组分析、预测物种地理起源的机器学习软件[简称:KLFDAPC] V0.1.0, 8170422, 原始取得, 全部权利, 2020-10-20 (软件著作权)

(3) 秦兴虎; 生物(遗传)多样性层次结构和地理分布可视化工具 [简称:HierDmap] V0.5.0, 8156441, 原始取得, 全部权利, 2019-9-20 (软件著作权)

(4) 秦兴虎; 跨度量跨尺度、从基因到生态系统分解生物多样性层级结构和分化的软件[简称:HierDpart] V1.5.0, 8156440, 原始取得, 全部权利, 2018-10-1 (软件著作权)

(5) 秦兴虎等;基于机器学习的高度近视风险预测模型和软件 [简称:EyeRisk] V1.1.0, 9402986, 原始取得, 全部权利, 2021-05-06 (软件著作权)